RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 ECE2O60344 883 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 TNIP1Q15025 636 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 RASSF10A6NK89 507 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 TRAF5O00463 557 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 VEGFBP49765 207 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 GCKRQ14397 625 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 DOK7Q18PE1 504 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 GREM2Q9H772 168 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRF-211ENST00000467464 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 UFL1O94874 794 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 CST9Q5W186 159 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 DPF2Q92785 391 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 EYA3Q99504 573 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 GGA1Q9UJY5 639 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 EGFRP00533 1210 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 MICALL2Q8IY33 904 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 LINS1Q8NG48 757 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF609O15014 1411 aa15.32■□□□□ 0.04
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PTPRF-211ENST00000467464 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 BEND3Q5T5X7 828 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.3■□□□□ 0.04
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PTPRF-211ENST00000467464 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 FAM161AQ3B820 660 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 MED23Q9ULK4 1368 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ATP2B4P23634 1241 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 GMLQ99445 158 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 SCN9AQ15858 1988 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 H7C1D1 291 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 FOXN1O15353 648 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ITGA6P23229 1130 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 FOXO4P98177 505 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 DLK2Q6UY11 383 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRF-211ENST00000467464 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 WBP1LQ9NX94 342 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 KLRK1P26718 216 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 PODNQ7Z5L7 613 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CAPNS2Q96L46 248 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 USP17L3A6NCW0 530 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 USP17L4A6NCW7 530 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 USP48Q86UV5 1035 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 MYH3P11055 1940 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ADM5C9JUS6 153 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 GRM8O00222 908 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 DACT2Q5SW24 774 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 G3V3G9 751 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 SNAP23O00161 211 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ALDH1L1O75891 902 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CHRNDQ07001 517 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRF-211ENST00000467464 KAZALD1Q96I82 304 aa15.21■□□□□ 0.03
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