RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.81	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	BRD1	O95696	1058 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	CABP4	P57796	275 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	AACS	Q86V21	672 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ABCA3	Q99758	1704 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118		A6NJR5	290 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	MYL6B	P14649	208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	PKP1	Q13835	747 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	MYD88	Q99836	296 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF445	P59923	1031 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AKAP9-208	ENST00000463118	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	CASP7	P55210	303 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PRSS12	P56730	875 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NUDT7	P0C024	238 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118		H7C1W4	665 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ATP5J	P18859	108 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	HSPA2	P54652	639 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.75	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PTH1R	Q03431	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ARID3A	Q99856	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TJP1	Q07157	1748 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	MBD3	O95983	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	IL2RB	P14784	551 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	AK2	P54819	239 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	MCM6	Q14566	821 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118		A0A087WZG4	1122 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	FOXO4	P98177	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AKAP9-208	ENST00000463118	RAD21	O60216	631 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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