RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GREM2Q9H772 168 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RASSF10A6NK89 507 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 H7C1W4 665 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ECE2O60344 883 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNIP1Q15025 636 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CYP4F22Q6NT55 531 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMC4Q7Z404 712 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MXD3Q9BW11 206 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 F6X3S4 739 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AOC2O75106 756 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UFL1O94874 794 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CASP7P55210 303 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FLIIQ13045 1269 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GRM1Q13255 1194 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP48Q86UV5 1035 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STK31Q9BXU1 1019 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCN9AQ15858 1988 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IL16Q14005 1332 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SNAP23O00161 211 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KLRK1P26718 216 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CTSWP56202 376 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GCKRQ14397 625 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR63Q8IWG1 891 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNS4Q8IZW8 715 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZIC5Q96T25 663 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WBP1LQ9NX94 342 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 H7C1D1 291 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LBX1P52954 281 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GGA1Q9UJY5 639 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADM5C9JUS6 153 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOXO4P98177 505 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM161AQ3B820 660 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DPF2Q92785 391 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CAPNS2Q96L46 248 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EYA3Q99504 573 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSKSQ9UJT2 592 aa9.8□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CSF1RP07333 972 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ITGA6P23229 1130 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BEND3Q5T5X7 828 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GMLQ99445 158 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPEF2Q9C093 1822 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 XDHP47989 1333 aa9.79□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 G3V3G9 751 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TAF5LO75529 589 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP2B4P23634 1241 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCARF1Q14162 830 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINS1Q8NG48 757 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF521Q96K83 1311 aa9.78□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP17L3A6NCW0 530 aa9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP17L4A6NCW7 530 aa9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHRNDQ07001 517 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms