RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 TMC4Q7Z404 712 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF609O15014 1411 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIN3BO60391 1043 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB11FIP3O75154 756 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 BBOX1O75936 387 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SASH1O94885 1247 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC24Q50LG9 513 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ERC1Q8IUD2 1116 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SLX4Q8IY92 1834 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 NUCB1Q02818 461 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC51AQ86UW1 340 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR108Q9NPR9 543 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB22O15209 634 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 FGFR2P21802 821 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SP8Q8IXZ3 490 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 SIL1Q9H173 461 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SH3BP4-207ENST00000454947 PDE8BO95263 885 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CHRNDQ07001 517 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 TFCP2Q12800 502 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.568e-6■■■□□ 15.8
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC93Q567U6 631 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 C21orf2O43822 256 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 TNNI3KQ59H18 835 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 XDHP47989 1333 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 PDE4AP27815 886 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 METTL24Q5JXM2 366 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 GPSM2P81274 684 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE4AQ14139 1066 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 LPIN2Q92539 896 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 STAP2Q9UGK3 403 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 MED23Q9ULK4 1368 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GUL7 405 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP2B3Q16720 1220 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 OLFM4Q6UX06 510 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 LNPKQ9C0E8 428 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 AOX1Q06278 1338 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-207ENST00000454947 CHD4Q14839 1912 aa11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms