RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.16□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.16□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.15□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JDP2Q8WYK2 163 aa14.15□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.15□□□□□ -0.14
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XDHP47989 1333 aa14.15□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.14□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.14□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR90Q96KV7 1748 aa14.14□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPIP5K2O43314 1243 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WASHC4Q2M389 1173 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPC2Q8N158 579 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.13□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP2B4P23634 1241 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AOC3Q16853 763 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EYA3Q99504 573 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GGA1Q9UJY5 639 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOMM70O94826 608 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXCL9Q07325 125 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTX1Q13505 466 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRAGCQ9HB90 399 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.11□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNAI3P08754 354 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHRNDQ07001 517 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NIM1KQ8IY84 436 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO3Q9UK99 471 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNNQ9UQP3 1299 aa14.1□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MED23Q9ULK4 1368 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF609O15014 1411 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YDJCA8MPS7 323 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf229H3BNL8 230 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEIS3Q99687 375 aa14.09□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCN4AP35499 1836 aa14.08□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP350Q5VT06 3117 aa14.08□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UFL1O94874 794 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1QTNF8P60827 252 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PODNQ7Z5L7 613 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.08□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RLBP1P12271 317 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCNN1DP51172 638 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNIP1Q15025 636 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPF2Q92785 391 aa14.07□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MS4A1P11836 297 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE4AQ14139 1066 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COPRSQ9NQ92 184 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.06□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIMBP2O15034 1052 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB22O15209 634 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ECE2O60344 883 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CIAO1O76071 339 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FSTL1Q12841 308 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EYA2O00167 538 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNAI2P04899 355 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms