RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
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SGO1-208ENST00000437051 ECE2O60344 883 aa23.81■■□□□ 1.4
SGO1-208ENST00000437051 VAMP4O75379 141 aa23.81■■□□□ 1.4
SGO1-208ENST00000437051 SLC4A2P04920 1241 aa23.81■■□□□ 1.4
SGO1-208ENST00000437051 CTSWP56202 376 aa23.81■■□□□ 1.4
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SGO1-208ENST00000437051 BEND3Q5T5X7 828 aa23.68■■□□□ 1.38
SGO1-208ENST00000437051 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.68■■□□□ 1.38
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SGO1-208ENST00000437051 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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SGO1-208ENST00000437051 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.64■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.64■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 LBX1P52954 281 aa23.63■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.63■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 GRM1Q13255 1194 aa23.62■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.62■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 PODNQ7Z5L7 613 aa23.62■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.62■■□□□ 1.37
SGO1-208ENST00000437051 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.62■■□□□ 1.37
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