RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436622.1

PFN4-202, Transcript of profilin family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene PFN4, Length 470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN4-202ENST00000436622 TMC4Q7Z404 712 aa26.87■■□□□ 1.89
PFN4-202ENST00000436622 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.87■■□□□ 1.89
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PFN4-202ENST00000436622 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.85■■□□□ 1.89
PFN4-202ENST00000436622 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PFN4-202ENST00000436622 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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PFN4-202ENST00000436622 NEFMP07197 916 aa26.84■■□□□ 1.89
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PFN4-202ENST00000436622 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.8■■□□□ 1.88
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PFN4-202ENST00000436622 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.73■■□□□ 1.87
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PFN4-202ENST00000436622 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.72■■□□□ 1.87
PFN4-202ENST00000436622 G3V3G9 751 aa26.72■■□□□ 1.87
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PFN4-202ENST00000436622 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.72■■□□□ 1.87
PFN4-202ENST00000436622 GMLQ99445 158 aa26.72■■□□□ 1.87
PFN4-202ENST00000436622 HTTP42858 3142 aa26.71■■□□□ 1.87
PFN4-202ENST00000436622 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.71■■□□□ 1.87
PFN4-202ENST00000436622 USP17L8P0C7I0 530 aa26.7■■□□□ 1.86
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PFN4-202ENST00000436622 CENPFP49454 3210 aa26.64■■□□□ 1.85
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PFN4-202ENST00000436622 USP17L4A6NCW7 530 aa26.62■■□□□ 1.85
PFN4-202ENST00000436622 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.62■■□□□ 1.85
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PFN4-202ENST00000436622 FZD1Q9UP38 647 aa26.62■■□□□ 1.85
PFN4-202ENST00000436622 BRCA2P51587 3418 aa26.61■■□□□ 1.85
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PFN4-202ENST00000436622 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.61■■□□□ 1.85
PFN4-202ENST00000436622 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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PFN4-202ENST00000436622 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.58■■□□□ 1.85
PFN4-202ENST00000436622 CHL1O00533 1208 aa26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 SPRYD7Q5W111 196 aa26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 PODNQ7Z5L7 613 aa26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 XDHP47989 1333 aa26.57■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 NF2P35240 595 aa26.56■■□□□ 1.84
PFN4-202ENST00000436622 NEUROD2Q15784 382 aa26.56■■□□□ 1.84
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