RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ADM5C9JUS6 153 aa19.43■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 VIL1P09327 827 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 SAGE1Q9NXZ1 904 aa19.43■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.42■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 RUNDC1Q96C34 613 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 SULF1Q8IWU6 871 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF186Q9NXI6 227 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 TAF1P21675 1872 aa19.39■□□□□ 0.7
ACTBP11-201ENST00000436287 SEC31BQ9NQW1 1179 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 GGA3Q9NZ52 723 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 TRPA1O75762 1119 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC10A3P09131 477 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 CSRNP1Q96S65 589 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 COL4A1P02462 1669 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 G3V3G9 751 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 UFL1O94874 794 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 CDCA5Q96FF9 252 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 GGA1Q9UJY5 639 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 SCARF1Q14162 830 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 MBIPQ9NS73 344 aa19.36■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLGA2Q08379 1002 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF853P0CG23 659 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 FKBP1BP68106 108 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 GMLQ99445 158 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF609O15014 1411 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP11-201ENST00000436287 PDE8AO60658 829 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 MYD88Q99836 296 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 USP17L8P0C7I0 530 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 XDHP47989 1333 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP2B4P23634 1241 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 PODNQ7Z5L7 613 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 MYOZ2Q9NPC6 264 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 USP17L3A6NCW0 530 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 USP17L4A6NCW7 530 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 USP17L1Q7RTZ2 530 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 SOX10P56693 466 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 IFT57Q9NWB7 429 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 SCN9AQ15858 1988 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDH10Q9P2E7 1040 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 GNAI1P63096 354 aa19.27■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 MOB2Q70IA6 237 aa19.27■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ACTBP11-201ENST00000436287 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 APAF1O14727 1248 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 CTSWP56202 376 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 NBPF9Q3BBW0 867 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 DACT2Q5SW24 774 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTBP11-201ENST00000436287 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.24■□□□□ 0.67
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