RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434435.1

SMARCAL1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1, human

TSL 4

Gene SMARCAL1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	BBOX1	O75936	387 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DPEP1	P16444	411 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435		A0A0G2JLW4	131 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SASH1	O94885	1247 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KCNA3	P22001	575 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CHRND	Q07001	517 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TFCP2	Q12800	502 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NUCB1	Q02818	461 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.61	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZNF609	O15014	1411 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PDE8B	O95263	885 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	BCL11A	Q9H165	835 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	XDH	P47989	1333 aa		28.57	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TAF5L	O75529	589 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	AACS	Q86V21	672 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KCNJ4	P48050	445 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GPSM2	P81274	684 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435		A0A1B0GUL7	405 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SLC5A1	P13866	664 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SMARCAL1-208	ENST00000434435	C21orf2	O43822	256 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FGFR2	P21802	821 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MPND	Q8N594	471 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LPIN2	Q92539	896 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.51	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CCDC93	Q567U6	631 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SNED1	Q8TER0	1413 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	UFL1	O94874	794 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TIMM10	P62072	90 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SNAP23	O00161	211 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PDE4A	P27815	886 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.46	■■■□□ 2.15

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