RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429794.1

CITED1-205, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-205ENST00000429794 RIMBP2O15034 1052 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-205ENST00000429794 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CITED1-205ENST00000429794 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CITED1-205ENST00000429794 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-205ENST00000429794 RTL9Q8NET4 1388 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 SHTN1A0MZ66 631 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 PDE8AO60658 829 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 MYD88Q99836 296 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 AOC2O75106 756 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ABHD8Q96I13 439 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 UFL1O94874 794 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 NOGQ13253 232 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 DOK7Q18PE1 504 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 USP48Q86UV5 1035 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 GGA1Q9UJY5 639 aa15.99■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CACNA1FO60840 1977 aa15.98■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 XDHP47989 1333 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 G3V3G9 751 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 EGFRP00533 1210 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 HUNKP57058 714 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.97■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CCDC27Q2M243 656 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 KSR2Q6VAB6 950 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.96■□□□□ 0.15
CITED1-205ENST00000429794 SPEF2Q9C093 1822 aa15.96■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ATP2B4P23634 1241 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 CTSWP56202 376 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 RGMBQ6NW40 437 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 SULF1Q8IWU6 871 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.95■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 PODNQ7Z5L7 613 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 TSPYL6Q8N831 410 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 CCDC102AQ96A19 550 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 STK31Q9BXU1 1019 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 GGA3Q9NZ52 723 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 TSKSQ9UJT2 592 aa15.94■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 MED23Q9ULK4 1368 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ADM5C9JUS6 153 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 IGKV5-2P06315 115 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.93■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ANP32CO43423 234 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 DLK2Q6UY11 383 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 GMLQ99445 158 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.92■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 USP17L3A6NCW0 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 USP17L4A6NCW7 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 USP17L8P0C7I0 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 IL16Q14005 1332 aa15.91■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 FKBP1BP68106 108 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 WWC1Q8IX03 1113 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 CDCA5Q96FF9 252 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 ZIC5Q96T25 663 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 GREM2Q9H772 168 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.9■□□□□ 0.14
CITED1-205ENST00000429794 H7C1W4 665 aa15.89■□□□□ 0.13
CITED1-205ENST00000429794 SLC10A3P09131 477 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms