RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 HYPKQ9NX55 129 aa23.82■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 RTL9Q8NET4 1388 aa23.81■■□□□ 1.4
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UPK3BP1-201ENST00000428678 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.81■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.8■■□□□ 1.4
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.76■■□□□ 1.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.76■■□□□ 1.39
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GGA1Q9UJY5 639 aa23.74■■□□□ 1.39
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UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.64■■□□□ 1.37
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CTSWP56202 376 aa23.6■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.6■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 MOB2Q70IA6 237 aa23.6■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.6■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPEF2Q9C093 1822 aa23.6■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXW7Q969H0 707 aa23.59■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH3P11055 1940 aa23.59■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 MED23Q9ULK4 1368 aa23.58■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.58■■□□□ 1.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.58■■□□□ 1.37
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