RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 EYA2O00167 538 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 OLFM4Q6UX06 510 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 HMMRO75330 724 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 SPEF2Q9C093 1822 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 GRIN3BO60391 1043 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 GPR162Q16538 588 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 CHRNDQ07001 517 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC24Q50LG9 513 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 PSMD1Q99460 953 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 XDHP47989 1333 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-201ENST00000425753 NFKBIEO00221 500 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 A0A1B0GUL6 1792 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 GPSM2P81274 684 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 MPNDQ8N594 471 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 SIL1Q9H173 461 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 PDE8BO95263 885 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 NEFLP07196 543 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 ATP2B4P23634 1241 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 METTL24Q5JXM2 366 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 VPS33BQ9H267 617 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 POLLQ9UGP5 575 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 GGA1Q9UJY5 639 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-201ENST00000425753 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 DCTPP1Q9H773 170 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 TAF5LO75529 589 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 UFL1O94874 794 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 SASH1O94885 1247 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 RASSF7Q02833 373 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 UBE4AQ14139 1066 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 MED23Q9ULK4 1368 aa25.24■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 FGFR2P21802 821 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 PRELPP51888 382 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 RAB11FIP3O75154 756 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 LMNB1P20700 586 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 EYA3Q99504 573 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 GPR108Q9NPR9 543 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 C6orf229H3BNL8 230 aa25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 TFCP2Q12800 502 aa25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
TSTA3-201ENST00000425753 SNAP23O00161 211 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 KCNJ4P48050 445 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 WASHC4Q2M389 1173 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 LPIN2Q92539 896 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF609O15014 1411 aa25.19■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 COL4A5P29400 1685 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 ATP2B3Q16720 1220 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 GCC1Q96CN9 775 aa25.18■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 PPIP5K2O43314 1243 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 AOC3Q16853 763 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 SMC5Q8IY18 1101 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-201ENST00000425753 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.6 ms