RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.77■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 G3V3G9 751 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TM4SF4P48230 202 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPSM2P81274 684 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCARF1Q14162 830 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFE2L2Q16236 605 aa21.75■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROSER3Q2NL68 480 aa21.75■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF609O15014 1411 aa21.74■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANXA1P04083 346 aa21.74■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.74■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKTNO75072 461 aa21.73■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SREBF2Q12772 1141 aa21.73■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.73■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.73■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.72■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF1P21675 1872 aa21.72■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.71■■□□□ 1.07
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP17L8P0C7I0 530 aa21.7■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NF2P35240 595 aa21.69■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOB2Q70IA6 237 aa21.69■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.69■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALDH1A1P00352 501 aa21.68■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM89AQ96GI7 184 aa21.68■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UFL1O94874 794 aa21.67■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.67■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGA1Q9UJY5 639 aa21.67■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.66■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GMLQ99445 158 aa21.66■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN9AQ15858 1988 aa21.65■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.65■■□□□ 1.06
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PODNQ7Z5L7 613 aa21.64■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP17L3A6NCW0 530 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP17L4A6NCW7 530 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF428Q96B54 188 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM17Q9Y577 477 aa21.63■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEFA5A3E0 1075 aa21.62■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INHBEP58166 350 aa21.62■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.62■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OGFOD1Q8N543 542 aa21.62■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.61■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL4A1P02462 1669 aa21.6■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMP14P50281 582 aa21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRYD7Q5W111 196 aa21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.59■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XDHP47989 1333 aa21.58■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSME4Q14997 1843 aa21.58■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIPK4P57078 832 aa21.58■■□□□ 1.05
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WNT10BO00744 389 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP2B4P23634 1241 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERO1AQ96HE7 468 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNL1Q8IU54 200 aa21.56■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.56■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.55■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARMC5Q96C12 935 aa21.55■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXB7P09629 217 aa21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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