RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 APAF1O14727 1248 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 UFL1O94874 794 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 EGFRP00533 1210 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 COL4A1P02462 1669 aa25■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.99■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 RTL9Q8NET4 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 ADM5C9JUS6 153 aa24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 GNAI1P63096 354 aa24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 IFT57Q9NWB7 429 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 GGA1Q9UJY5 639 aa24.97■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 CA12O43570 354 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF853P0CG23 659 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 NOGQ13253 232 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 FAM161AQ3B820 660 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 ZIC5Q96T25 663 aa24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 PDE8AO60658 829 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 GGA3Q9NZ52 723 aa24.93■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 RGMBQ6NW40 437 aa24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 SULF1Q8IWU6 871 aa24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.92■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.91■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.9■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 DGKZQ13574 1117 aa24.89■■□□□ 1.58
UBXN4-202ENST00000415164 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 FBXW7Q969H0 707 aa24.88■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 XDHP47989 1333 aa24.87■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 SCARF1Q14162 830 aa24.87■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 CDCA5Q96FF9 252 aa24.87■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 ATP2B4P23634 1241 aa24.86■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 TSPYL6Q8N831 410 aa24.86■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC102AQ96A19 550 aa24.86■■□□□ 1.57
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UBXN4-202ENST00000415164 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 CTSWP56202 376 aa24.85■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.85■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 STK31Q9BXU1 1019 aa24.85■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.84■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.84■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.84■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 SCN9AQ15858 1988 aa24.84■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L8P0C7I0 530 aa24.83■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 KSR2Q6VAB6 950 aa24.83■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.83■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.83■■□□□ 1.57
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L3A6NCW0 530 aa24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L4A6NCW7 530 aa24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 TRPA1O75762 1119 aa24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 GREM2Q9H772 168 aa24.82■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 IGKV5-2P06315 115 aa24.81■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 SLC10A3P09131 477 aa24.8■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 PODNQ7Z5L7 613 aa24.8■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 MXD3Q9BW11 206 aa24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 RNF186Q9NXI6 227 aa24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.79■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.78■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.77■■□□□ 1.56
UBXN4-202ENST00000415164 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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