RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 GLI3P10071 1580 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 NEK4P51957 841 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 HLFQ16534 295 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 PALD1Q9ULE6 856 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.83□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.82□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf72A6NCS6 295 aa4.82□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 SGSM2O43147 1006 aa4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 TNNI3KQ59H18 835 aa4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.82□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 PHLPP1O60346 1717 aa4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC24Q50LG9 513 aa4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.82□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.82□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 COL15A1P39059 1388 aa4.81□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.81□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 POTEBQ6S5H4 581 aa4.81□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 HIP1O00291 1037 aa4.8□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 MCM4P33991 863 aa4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ITPK1Q13572 414 aa4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 IFFO2Q5TF58 517 aa4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGB4P16144 1822 aa4.8□□□□□ -1.64
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