RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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CBX1-202ENST00000393408 CBX8Q9HC52 389 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-202ENST00000393408 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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CBX1-202ENST00000393408 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.26■■□□□ 1.15
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CBX1-202ENST00000393408 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-202ENST00000393408 ZNF75DP51815 510 aa22.2■■□□□ 1.14
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CBX1-202ENST00000393408 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.19■■□□□ 1.14
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CBX1-202ENST00000393408 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.19■■□□□ 1.14
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CBX1-202ENST00000393408 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.18■■□□□ 1.14
CBX1-202ENST00000393408 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.18■■□□□ 1.14
CBX1-202ENST00000393408 NBPF26B4DH59 902 aa22.17■■□□□ 1.14
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CBX1-202ENST00000393408 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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CBX1-202ENST00000393408 E7EWF7 191 aa22.14■■□□□ 1.13
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CBX1-202ENST00000393408 IQCB1Q15051 598 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX1-202ENST00000393408 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
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