RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 CREBZFQ9NS37 354 aa34.42■■■■□ 3.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 WASHC4Q2M389 1173 aa34.41■■■■□ 3.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CIAPIN1Q6FI81 312 aa34.41■■■■□ 3.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTROBQ8N137 903 aa34.41■■■■□ 3.1
GNPTAB-202ENST00000392919 C6orf229H3BNL8 230 aa34.4■■■■□ 3.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GPRC5DQ9NZD1 345 aa34.4■■■■□ 3.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 DBNDD1Q9H9R9 158 aa34.37■■■■□ 3.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ALDH1L1O75891 902 aa34.36■■■■□ 3.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 DOK7Q18PE1 504 aa34.34■■■■□ 3.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 PODXL2Q9NZ53 605 aa34.34■■■■□ 3.09
GNPTAB-202ENST00000392919 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP34.33■■■■□ 3.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 SHTN1A0MZ66 631 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM88BA6NKF7 163 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 GREM2Q9H772 168 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 UFL1O94874 794 aa34.31■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 EYA3Q99504 573 aa34.31■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMD14O00487 310 aa34.3■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 ECE2O60344 883 aa34.3■■■■□ 3.08
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GNPTAB-202ENST00000392919 SPEF2Q9C093 1822 aa34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 RTL9Q8NET4 1388 aa34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 GRM8O00222 908 aa34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 GGA1Q9UJY5 639 aa34.28■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTNAP1P78357 1384 aa34.27■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
GNPTAB-202ENST00000392919 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
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GNPTAB-202ENST00000392919 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
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GNPTAB-202ENST00000392919 XDHP47989 1333 aa34.25■■■■□ 3.07
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GNPTAB-202ENST00000392919 RCAN3Q9UKA8 241 aa34.23■■■■□ 3.07
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GNPTAB-202ENST00000392919 PCNTO95613 3336 aa34.22■■■■□ 3.07
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
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GNPTAB-202ENST00000392919 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
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GNPTAB-202ENST00000392919 USP44Q9H0E7 712 aa34.21■■■■□ 3.07
GNPTAB-202ENST00000392919 H7C1D1 291 aa34.2■■■■□ 3.07
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GNPTAB-202ENST00000392919 FAM161AQ3B820 660 aa34.2■■■■□ 3.07
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD7Q7Z3H4 446 aa34.2■■■■□ 3.07
GNPTAB-202ENST00000392919 PGAP2Q9UHJ9 254 aa34.2■■■■□ 3.07
GNPTAB-202ENST00000392919 CSF1RP07333 972 aa34.19■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGA6P23229 1130 aa34.19■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP2B4P23634 1241 aa34.19■■■■□ 3.06
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GNPTAB-202ENST00000392919 EPHA10Q5JZY3 1008 aa34.18■■■■□ 3.06
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GNPTAB-202ENST00000392919 RPS12P25398 132 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB115Q30KQ5 88 aa34.15■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
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