RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 CARNS1A5YM72 827 aa5.58□□□□□ -1.52
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.58□□□□□ -1.52
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SNORD3E-201ENST00000362899 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SNORD3E-201ENST00000362899 SOX18P35713 384 aa5.58□□□□□ -1.52
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SNORD3E-201ENST00000362899 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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SNORD3E-201ENST00000362899 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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SNORD3E-201ENST00000362899 ELP3Q9H9T3 547 aa5.53□□□□□ -1.52
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SNORD3E-201ENST00000362899 CEP120Q8N960 986 aa5.52□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.52□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 LINC01387J3KSC0 135 aa5.51□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 TRPA1O75762 1119 aa5.51□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC25BP30305 580 aa5.51□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.51□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 WISP1O95388 367 aa5.5□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 HHIPQ96QV1 700 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 CHRDQ9H2X0 955 aa5.5□□□□□ -1.53
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SNORD3E-201ENST00000362899 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 POLIQ9UNA4 740 aa5.5□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 NFKBIEO00221 500 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 EPHA1P21709 976 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC27P30260 824 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 C8orf34Q49A92 452 aa5.49□□□□□ -1.53
SNORD3E-201ENST00000362899 XKR5Q6UX68 686 aa5.49□□□□□ -1.53
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