RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 BARGINQ6ZT62 677 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PLCG2P16885 1265 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 XAGE2Q96GT9 111 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 GREM2Q9H772 168 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 LPIN2Q92539 896 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DLGAP5Q15398 846 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TEX11Q8IYF3 940 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX11Q96FC9 970 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TECPR2O15040 1411 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TTLL6Q8N841 843 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 USP44Q9H0E7 712 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 NARFQ9UHQ1 456 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DCCP43146 1447 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 C21orf2O43822 256 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPY3P0CV98 308 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPY8P0CW00 308 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PDCP20941 246 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 GYG1P46976 350 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 HLFQ16534 295 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP10Q86W26 655 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TCP10Q12799 353 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MCM2P49736 904 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TNNI3KQ59H18 835 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DCTPP1Q9H773 170 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PIM2Q9P1W9 311 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CDKL5O76039 1030 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 BEND3Q5T5X7 828 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TPM4P67936 248 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SUSD4Q5VX71 490 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 HOMER1Q86YM7 354 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 KAT14Q9H8E8 782 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DLC1Q96QB1 1528 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PPFIA3O75145 1194 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 ADRA2BP18089 450 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MICU3Q86XE3 530 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SDSP20132 328 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 ATP2B4P23634 1241 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNDQ07001 517 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 BBOX1O75936 387 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 RAD17O75943 681 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MBD4O95243 580 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 SCNN1DP51172 638 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC93Q567U6 631 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC22Q5TAA0 569 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CPS1P31327 1500 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 NUCB1Q02818 461 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRC24Q50LG9 513 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 PTMSP20962 102 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC6Q86TZ1 520 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 KDRP35968 1356 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 COL15A1P39059 1388 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM3-201ENST00000361320 MAST3O60307 1309 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms