RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MTX1Q13505 466 aa27.86■■■□□ 2.05
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HOXD4-201ENST00000306324 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 LTBP1Q14766 1721 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 GPSM2P81274 684 aa27.84■■■□□ 2.05
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HOXD4-201ENST00000306324 SIL1Q9H173 461 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD4-201ENST00000306324 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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HOXD4-201ENST00000306324 XDHP47989 1333 aa27.81■■■□□ 2.04
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HOXD4-201ENST00000306324 POLLQ9UGP5 575 aa27.78■■■□□ 2.04
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.72■■■□□ 2.03
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HOXD4-201ENST00000306324 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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HOXD4-201ENST00000306324 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD4-201ENST00000306324 SNAP23O00161 211 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD4-201ENST00000306324 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
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HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
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HOXD4-201ENST00000306324 COL4A5P29400 1685 aa27.69■■■□□ 2.02
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HOXD4-201ENST00000306324 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 JDP2Q8WYK2 163 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.69■■■□□ 2.02
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HOXD4-201ENST00000306324 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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HOXD4-201ENST00000306324 TFCP2Q12800 502 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 DOK7Q18PE1 504 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD4-201ENST00000306324 SASH1O94885 1247 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD4-201ENST00000306324 APBB1O00213 710 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD4-201ENST00000306324 ECE2O60344 883 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2B3Q16720 1220 aa27.61■■■□□ 2.01
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