RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTN1Q14203 1278 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA5Q96FF9 252 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 GGA3Q9NZ52 723 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 YDJCA8MPS7 323 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMBP2O15034 1052 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ECE2O60344 883 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 FKTNO75072 461 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-201ENST00000296642 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR25O00155 361 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D8O95759 1140 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 INHBEP58166 350 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP10Q86W26 655 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 SHTN1A0MZ66 631 aa10.31□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 TM4SF4P48230 202 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP14P50281 582 aa10.31□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF6Q15052 776 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC9Q7Z3E5 817 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 OGFOD1Q8N543 542 aa10.31□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.31□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L8P0C7I0 530 aa10.3□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.3□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.3□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.29□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.29□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 DLK2Q6UY11 383 aa10.29□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS6Q7L5N1 327 aa10.29□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF609O15014 1411 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFRP00533 1210 aa10.28□□□□□ -0.76
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPSM2P81274 684 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 NFE2L2Q16236 605 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 PODNQ7Z5L7 613 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 POLLQ9UGP5 575 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO3BQ8WXR4 1341 aa10.28□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL9Q8NET4 1388 aa10.27□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.27□□□□□ -0.76
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L3A6NCW0 530 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L4A6NCW7 530 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 UFL1O94874 794 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE6P0CI01 402 aa10.27□□□□□ -0.77
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PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF11Q86T75 865 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC51AQ86UW1 340 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.27□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
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PGGT1B-201ENST00000296642 LAMB2P55268 1798 aa10.26□□□□□ -0.77
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R1AP30153 589 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.26□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 UNCXA6NJT0 531 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2B4P23634 1241 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 PDIA6Q15084 440 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.25□□□□□ -0.77
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