RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 C1QTNF8P60827 252 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 WASHC4Q2M389 1173 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 GGA1Q9UJY5 639 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 MINPP1Q9UNW1 487 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL2-201ENST00000296031 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 EYA3Q99504 573 aa31.44■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 XDHP47989 1333 aa31.44■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 RIMBP2O15034 1052 aa31.43■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC57Q2TAC2 916 aa31.43■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa31.43■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.43■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 POTECB2RU33 542 aa31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM27P14373 513 aa31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 TAF7LQ5H9L4 462 aa31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 GPC2Q8N158 579 aa31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 GJA3Q9Y6H8 435 aa31.41■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 TNNQ9UQP3 1299 aa31.4■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 TOMM70O94826 608 aa31.39■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2B4P23634 1241 aa31.39■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa31.39■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD44Q8N8A2 993 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 SCN4AP35499 1836 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.37■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD2Q9GZV1 360 aa31.37■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 DBNDD1Q9H9R9 158 aa31.37■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 DOK7Q18PE1 504 aa31.36■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 IQCA1LA6NCM1 817 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL9Q07325 125 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GUL6 1792 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 YDJCA8MPS7 323 aa31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 ECE2O60344 883 aa31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 RAD17O75943 681 aa31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 CHRNDQ07001 517 aa31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa31.34■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 G3V3G9 751 aa31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 DCAF8Q5TAQ9 597 aa31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 CIAPIN1Q6FI81 312 aa31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 LEMD3Q9Y2U8 911 aa31.33■■■□□ 2.61
CXCL2-201ENST00000296031 MEIS3Q99687 375 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 CNNM1Q9NRU3 951 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 HACL1Q9UJ83 578 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 KCNJ4P48050 445 aa31.3■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 TNIP1Q15025 636 aa31.3■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 MED23Q9ULK4 1368 aa31.3■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF804BA4D1E1 1349 aa31.29■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 TAF5LO75529 589 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 GNAI3P08754 354 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 SCN9AQ15858 1988 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 EPHX2P34913 555 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 SCNN1DP51172 638 aa31.27■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CXCL2-201ENST00000296031 PLIN1O60240 522 aa31.26■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 KCNQ5Q9NR82 932 aa31.26■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 PSMD14O00487 310 aa31.25■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 SMC1BQ8NDV3 1235 aa31.25■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 KLHDC4Q8TBB5 520 aa31.25■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.25■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 SNAP23O00161 211 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 POTEIP0CG38 1075 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 POTEJP0CG39 1038 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 KLRK1P26718 216 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 EPS15P42566 896 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 FSTL1Q12841 308 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 TXNRD3Q86VQ6 643 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa31.24■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 PODNQ7Z5L7 613 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 PSME4Q14997 1843 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC24Q50LG9 513 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 GPRC5DQ9NZD1 345 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 RLBP1P12271 317 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 COA1Q9GZY4 146 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL2-201ENST00000296031 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CXCL2-201ENST00000296031 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms