RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 GRM1Q13255 1194 aa25.26■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.26■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 LBX1P52954 281 aa25.25■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC27Q2M243 656 aa25.25■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.25■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 KSR2Q6VAB6 950 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 WWC1Q8IX03 1113 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 STK31Q9BXU1 1019 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 RTL9Q8NET4 1388 aa25.23■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.23■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 UFL1O94874 794 aa25.23■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.23■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.23■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.22■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 GGA1Q9UJY5 639 aa25.22■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV5-2P06315 115 aa25.21■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CXCL3-201ENST00000296026 G3V3G9 751 aa25.2■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.2■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.2■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 USP48Q86UV5 1035 aa25.2■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.2■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 EGFRP00533 1210 aa25.19■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 SCN9AQ15858 1988 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 AOC2O75106 756 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 CTSWP56202 376 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 G2E3Q7L622 706 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.18■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 XDHP47989 1333 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 IL16Q14005 1332 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A2P04920 1241 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 MAP2K2P36507 400 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 MRS2Q9HD23 443 aa25.17■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 DLK2Q6UY11 383 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.16■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.15■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 MYH3P11055 1940 aa25.14■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2B4P23634 1241 aa25.14■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.14■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 GREM2Q9H772 168 aa25.14■■□□□ 1.62
CXCL3-201ENST00000296026 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.13■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 H7C1W4 665 aa25.12■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 SPEF2Q9C093 1822 aa25.12■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.12■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ADM5C9JUS6 153 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ANP32CO43423 234 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 HUNKP57058 714 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 FLIIQ13045 1269 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 PSME4Q14997 1843 aa25.1■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 PODNQ7Z5L7 613 aa25.1■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 GGA3Q9NZ52 723 aa25.1■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF609O15014 1411 aa25.1■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 GCKRQ14397 625 aa25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 TSKSQ9UJT2 592 aa25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 WDR63Q8IWG1 891 aa25.08■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 SULF1Q8IWU6 871 aa25.08■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.08■■□□□ 1.61
CXCL3-201ENST00000296026 MED23Q9ULK4 1368 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L3A6NCW0 530 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L4A6NCW7 530 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 GMLQ99445 158 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.07■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 VAMP4O75379 141 aa25.06■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L8P0C7I0 530 aa25.06■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CXCL3-201ENST00000296026 NOGQ13253 232 aa25.06■■□□□ 1.6
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