RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.68■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 WDR97A6NE52 1622 aa18.68■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.68■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.68■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 VEZTQ9HBM0 779 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 EPSTI1Q96J88 318 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 KRT23Q9C075 422 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 GRIN2BQ13224 1484 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CRCPO75575 148 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SATB1Q01826 763 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.67■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 TRAF1Q13077 416 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CCT6BQ92526 530 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 MNAT1P51948 309 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 RTN1Q16799 776 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CFAP157Q5JU67 520 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CTAGE9A4FU28 777 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF165P49910 485 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 NAPAP54920 295 aa18.66■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CYP7A1P22680 504 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 UBE2HP62256 183 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB43O43298 467 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC114Q96M63 670 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 MSL1Q68DK7 614 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC25Q86WR0 208 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM23A6NLE4 172 aa18.64■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 TTC36A6NLP5 189 aa18.64■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.64■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC77Q9BR77 488 aa18.64■□□□□ 0.58
LAMC1-201ENST00000258341 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM7Q9C029 511 aa18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ALG1Q9BT22 464 aa18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 MCM6Q14566 821 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 SLFN5Q08AF3 891 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6V1AP38606 617 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 SSFA2P28290 1259 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ESR2Q92731 530 aa18.63■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ASIC1P78348 528 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 SP4Q02446 784 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 RASA3Q14644 834 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 DAPK1P53355 1430 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 BIRC2Q13490 618 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 TMTC2Q8N394 836 aa18.62■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R7Q15435 360 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PSMA7O14818 248 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KRT5P13647 590 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KIF5AQ12840 1032 aa18.61■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 FLIIQ13045 1269 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 GABPAQ06546 454 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 KIFC2Q96AC6 838 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.59■□□□□ 0.57
LAMC1-201ENST00000258341 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms