RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZVU0 165 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 PHC3Q8NDX5 983 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 APPBP2Q92624 585 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC7Q99615 494 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CNTN3Q9P232 1028 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 MEN1O00255 615 aa8.35□□□□□ -1.07
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MDM2-201ENST00000258148 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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MDM2-201ENST00000258148 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 NLRP3Q96P20 1036 aa8.34□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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MDM2-201ENST00000258148 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.34□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.34□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.33□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 TKFCQ3LXA3 575 aa8.32□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.32□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.32□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.31□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 SV2BQ7L1I2 683 aa8.31□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.31□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 ABCB6Q9NP58 842 aa8.31□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 LIG3P49916 1009 aa8.3□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.3□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 EHD4Q9H223 541 aa8.3□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.3□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 PPT2Q9UMR5 302 aa8.3□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.3□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 CELA3AP09093 270 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 ATP4AP20648 1035 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 LMNB2Q03252 620 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 JMYQ8N9B5 988 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.29□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 FEZ1Q99689 392 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 IER2Q9BTL4 223 aa8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 GIPRP48546 466 aa8.28□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 PTPN5P54829 565 aa8.28□□□□□ -1.08
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MDM2-201ENST00000258148 NNTQ13423 1086 aa8.28□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 GNASQ5JWF2 1037 aa8.28□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.28□□□□□ -1.08
MDM2-201ENST00000258148 JDP2Q8WYK2 163 aa8.28□□□□□ -1.08
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