RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mmp14P53690 582 aa26.15■■□□□ 1.78
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tm4sf4Q91XD3 202 aa26.14■■□□□ 1.78
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cxcl9P18340 126 aa26.11■■□□□ 1.77
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Chmp3Q9CQ10 224 aa26.1■■□□□ 1.77
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ppil2Q9D787 521 aa26.1■■□□□ 1.77
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Polr3dQ91WD1 398 aa26.04■■□□□ 1.76
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Trappc12Q8K2L8 797 aa26.03■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ripk3Q9QZL0 486 aa26.03■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 InsrrQ9WTL4 1300 aa26.03■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Casp1P29452 402 aa26.02■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 LdhdQ7TNG8 484 aa26.02■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 RubcnQ80U62 956 aa26.02■■□□□ 1.76
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Q3UPC7 1272 aa26.01■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Foxn1Q61575 648 aa26.01■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sall2Q9QX96 1004 aa26.01■■□□□ 1.75
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nlrp9bQ66X22 1003 aa26■■□□□ 1.75
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Osbpl5Q9ER64 874 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 ParvgQ9ERD8 331 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sh3bp5Q9Z131 463 aa26■■□□□ 1.75
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Q3UJP5 209 aa25.99■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Evi5P97366 809 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 VgfQ0VGU4 617 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ankrd13cQ3UX43 541 aa25.98■■□□□ 1.75
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Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Adora1Q60612 326 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ofd1Q80Z25 1017 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc142Q8CAI1 738 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lman1lQ8VCD3 505 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AppP12023 770 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ndfip2Q91ZP6 311 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ripk4Q9ERK0 786 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 HunkO88866 714 aa25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ftl2P49945 183 aa25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sez6lQ6P1D5 963 aa25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tceal9Q9DD24 104 aa25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NrapQ80XB4 1728 aa25.96■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cfap44E9Q5M6 1843 aa25.95■■□□□ 1.75
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Slain1Q68FF7 579 aa25.95■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Myo1bP46735 1107 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ttll12Q3UDE2 639 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Akap4Q60662 849 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Jarid2Q62315 1234 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tll1Q62381 1013 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Q8C5K5 320 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Shtn1Q8K2Q9 631 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sirt2Q8VDQ8 389 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Foxd1Q61345 456 aa25.93■■□□□ 1.74
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