RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		H0Y980	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R1W7	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRY2	O43597	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CST8	O60676	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA21	P01568	189 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA17	P01571	189 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	B4GALT1	P15291	398 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB1	P30740	379 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	GSK3B	P49841	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF75D	P51815	510 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ARFIP1	P53367	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	HES1	Q14469	280 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFA2	O43678	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SEMA3D	O95025	777 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNA5	P01569	189 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT1	P21579	422 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	GDF5	P43026	501 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNLT3	P51808	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CD81	P60033	236 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ISL1	P61371	349 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CBFB	Q13951	182 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	EGFL8	Q99944	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NHS1	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BNH8	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BSA7	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMD3	O43242	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FCN3	O75636	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PTH	P01270	115 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CTRB1	P17538	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNO	P22674	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRA3	P34903	492 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SSX2	Q16385	188 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZR03	302 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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