RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 DRD4P21917 467 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CRYBA2P53672 197 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 HSF2Q03933 536 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TSTQ16762 297 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 C1QL2Q7Z5L3 287 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 OR4M2Q8NGB6 313 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SAP30LQ9HAJ7 183 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SIAEQ9HAT2 523 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 J3QLI3 93 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPT2O15123 496 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MT-ND1P03886 318 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 FUT1P19526 365 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 DAP3P51398 398 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 GLO1Q04760 184 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 HFEQ30201 348 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf56Q8N813 242 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 OR10A6Q8NH74 314 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 STON2Q8WXE9 905 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 JMJD8Q96S16 334 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NANOGQ9H9S0 305 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 OR7A10O76100 309 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 STOMP27105 288 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 AQP2P41181 271 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF81P51508 661 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 FAM209AQ5JX71 171 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC80Q76M96 950 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 PFN4Q8NHR9 129 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TSPEARQ8WU66 669 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 RAB1CQ92928 201 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TIMD4Q96H15 378 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 KCNN2Q9H2S1 579 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 INIPQ9NRY2 104 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A10O95528 541 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 IGF2P01344 180 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN19P0C672 248 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCNOP22674 350 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CDAP32320 146 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 WNT5AP41221 380 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 RBM34P42696 430 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 GZMMP51124 257 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MMP15P51511 669 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NFYCQ13952 458 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 VMACQ2NL98 169 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF12L2Q5VW00 463 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF101Q8IZC7 436 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NABP1Q96AH0 204 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ELMOD3Q96FG2 381 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SUCNR1Q9BXA5 334 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-46P01743 117 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF32P17041 273 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 ADRA2CP18825 462 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MAKP20794 623 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 LIMS1P48059 325 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM255AQ5JRV8 349 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 THEM4Q5T1C6 240 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MOSPD2Q8NHP6 518 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NANPQ8TBE9 248 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 LIPHQ8WWY8 451 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SGTBQ96EQ0 304 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 LOC100509620A0A075B734 347 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPB13A6NJU9 1138 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPB4C9JG80 1138 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SPRY3O43610 288 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 EGR1P18146 543 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 GATA3P23771 443 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 GCH1P30793 250 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 MPV17P39210 176 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA46Q5T0L3 261 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SGMS2Q8NHU3 365 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCL17Q92583 94 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A7Q99884 636 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms