RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR2T27Q8NH04 317 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF519Q8TB69 540 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ASB10Q8WXI3 467 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 APH1AQ96BI3 265 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OTULINQ96BN8 352 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM80Q96HE8 168 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 COPS4Q9BT78 406 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 JAM3Q9BX67 310 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP21Q9H596 190 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MED12Q93074 2177 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GTH9 108 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 B4DXG7 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 H3BS24 57 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC1A7O00341 560 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PRKYO43930 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RAB36O95755 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IL18BPO95998 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CLPTM1O96005 669 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LYNP07948 512 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GNAO1P09471 354 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GABRB1P18505 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CRHBPP24387 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OPRM1P35372 400 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RANBP1P43487 201 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 STARP49675 285 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY4P51582 365 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NUDT6P53370 316 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 NR1H2P55055 460 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 BIDP55957 195 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN17P56750 224 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GGTLC2Q14390 218 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 KLHL12Q53G59 568 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TEX30Q5JUR7 227 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NIPAL3Q6P499 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.5□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDH24Q86UP0 819 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR4K13Q8NH42 304 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 THRSPQ92748 146 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 Q96M66 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 Q96M85 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TAAR6Q96RI8 345 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TEAD3Q99594 435 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MND1Q9BWT6 205 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PIGMQ9H3S5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NIPAL2Q9H841 368 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SP140LQ9H930 580 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 GLTPQ9NZD2 209 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UPB1Q9UBR1 384 aa6.5□□□□□ -1.37
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