RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERVK-25	P63136	954 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FMOD	Q06828	376 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DOK1	Q99704	481 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CR1	P17927	2039 aa		13.89	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PPL8	197 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825		M0R233	179 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SYNGR3	O43761	229 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	GPRIN2	O60269	458 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NDUFB2	O95178	105 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ADRA2A	P08913	450 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCNO	P22674	350 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAD52	P43351	418 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NF1	P21359	2839 aa		13.88	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PPW3	197 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARPC2	O15144	300 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD5L	O43866	347 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DIRAS1	O95057	198 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	GADD45G	O95257	159 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FABP3	P05413	133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	LCK	P06239	509 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD14	P08571	375 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCL2	P13500	99 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	PCBD1	P61457	104 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	VLDLR	P98155	873 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPIB	Q01892	262 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	SNAP29	O95721	258 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	DAO	P14920	347 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF32	P17041	273 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	IFNGR2	P38484	337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FXN	Q16595	210 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825		B2RBV5	119 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825		H7C1C5	153 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	AHCYL1	O43865	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM107A	O95990	144 aa		13.85	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms