RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MISPQ8IVT2 679 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CARFQ8N187 725 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 DTX3Q8N9I9 347 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6N2Q8NGY6 317 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 VWCEQ96DN2 955 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC41A2Q96JW4 573 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PTCHD1Q96NR3 888 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC46A1Q96NT5 459 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NPAS1Q99742 590 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GABRG3Q99928 467 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ORAI3Q9BRQ5 295 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC11CQ9BY50 192 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LAT2Q9GZY6 243 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ATG5Q9H1Y0 275 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 IFT22Q9H7X7 185 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF22Q9HCT0 170 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP26Q9NRE1 261 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP57Q9NU63 452 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM100Q9NV29 134 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MEMO1Q9Y316 297 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 WIF1Q9Y5W5 379 aa7□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRSQ13332 1948 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PP55 124 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM218A2RU14 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM25EA8MYX2 175 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 H0YIG0 161 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LDLRAD4O15165 306 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSVO60911 334 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM4BO94953 1096 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR6A2O95222 327 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NTN1O95631 604 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RLN2P04090 185 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CD3DP04234 171 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 AMY2AP04746 511 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL5P13501 91 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FOLR2P14207 255 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PGCP20142 388 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD11B1P28845 292 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NTSR1P30989 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 AKT2P31751 481 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGER1P34995 402 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTR1BP42025 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PPICP45877 212 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR3P46089 330 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ADPRHP54922 357 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN2P57739 230 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTR1AP61163 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 BLOC1S1P78537 153 aa6.99□□□□□ -1.29
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CAPNS1-202ENST00000586851 DHRS2Q13268 280 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FGL2Q14314 439 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 PPA1Q15181 289 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 STK11Q15831 433 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SGCBQ16585 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM225Q6GV28 225 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT9Q86SS6 491 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 CACUL1Q86Y37 369 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM8Q8N371 416 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-202ENST00000586851 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.99□□□□□ -1.29
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