RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ETV7Q9Y603 341 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CACNG2Q9Y698 323 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 REV3LO60673 3130 aa5.68□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MYO9BQ13459 2157 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 OR6C68A6NDL8 312 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TMEM212A6NML5 194 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CENPBD1B2RD01 187 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 XKRYO14609 159 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 SELENOFO60613 162 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ICOSLGO75144 302 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ECDO95905 644 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 C1QBP02746 253 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 BGLAPP02818 100 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 GP1BBP13224 206 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ARSBP15848 533 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 AHCYP23526 432 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CXCR1P25024 350 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TACR3P29371 465 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 HOXD12P35452 270 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 AQP2P41181 271 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 P2RX1P51575 399 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MAP2K6P52564 334 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 DLX5P56178 289 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 SLC26A5P58743 744 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ACY1Q03154 408 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ZNF117Q03924 483 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 EGR4Q05215 589 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MAB21L1Q13394 359 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CDK10Q15131 360 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ANGPT1Q15389 498 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CARTPTQ16568 116 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 Q499Y3 187 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 PLA1AQ53H76 456 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 PCSK4Q6UW60 755 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TIGD4Q8IY51 512 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 FRMD1Q8N878 549 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TMEM234Q8WY98 164 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NSMAFQ92636 917 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 UPRTQ96BW1 309 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 RASD2Q96D21 266 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 DERL3Q96Q80 235 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 LPAR4Q99677 370 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ABCG5Q9H222 651 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 WDR76Q9H967 626 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 NLKQ9UBE8 527 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MALT1Q9UDY8 824 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 CA14Q9ULX7 337 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 COPS3Q9UNS2 423 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 ALG5Q9Y673 324 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 FKBP7Q9Y680 259 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.67□□□□□ -1.5
CLTC-211ENST00000579815 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms