RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ADAM10O14672 748 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CTSLP07711 333 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SERPINA2P20848 420 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GABRR1P24046 479 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 HSD17B7P56937 341 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 C12orf57Q99622 126 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IL21Q9HBE4 155 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SHOXO15266 292 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 WNT1P04628 370 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR1D4P47884 311 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RAB30Q15771 203 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 LYG2Q86SG7 212 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ST7LQ8TDW4 575 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ALG14Q96F25 216 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR5B2Q96R09 309 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FKRPQ9H9S5 495 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 VDAC3Q9Y277 283 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM77I1YAP6 450 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SULT2B1O00204 365 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CCSO14618 274 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MSTNO14793 375 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF10CO14798 259 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ATP1B3P54709 279 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RNF212Q495C1 297 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 C10orf111Q8N326 155 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SLAMF9Q96A28 289 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FGGYQ96C11 551 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ABHD1Q96SE0 405 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SCN4AP35499 1836 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FITM1A5D6W6 292 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 P2RY10O00398 339 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SLC17A2O00624 439 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 BRINP1O60477 761 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SYNGR4O95473 234 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IGHA1P01876 353 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TK1P04183 234 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ACY1Q03154 408 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 TMED6Q8WW62 240 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 HAS2Q92819 552 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CRB3Q9BUF7 120 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 OBP2AQ9NY56 170 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 SMCO3A2RU48 225 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf66A4D0T2 115 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R2P9O14990 202 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF217O75362 1048 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RAB1AP62820 205 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 PHF19Q5T6S3 580 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-205ENST00000577827 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms