RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PGAP1	Q75T13	922 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ELMO1	Q92556	727 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RAPGEF5	Q92565	580 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	UFD1	Q92890	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MBOAT4	Q96T53	435 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	APOL2	Q9BQE5	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RBKS	Q9H477	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	EXO5	Q9H790	373 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LY9	Q9HBG7	655 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PAK5	Q9P286	719 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LAMA5	O15230	3695 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TSC2	P49815	1807 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IGF2R	P11717	2491 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WWV3	80 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PQ72	361 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ARL5C	A6NH57	179 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		H0YIV9	168 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DCTN6	O00399	190 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL16	O15467	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJB6	O75190	326 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf105	O95561	183 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	STAMBP	O95630	424 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LALBA	P00709	142 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CHML	P26374	656 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR1F	P30939	366 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SYK	P43405	635 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PKNOX1	P55347	436 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OXA1L	Q15070	435 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMD5	Q16401	504 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RAET1L	Q5VY80	246 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CGB2	Q6NT52	195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC31	Q6UY01	552 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	BIVM	Q86UB2	503 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB124	Q8NES8	71 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP11	Q8TF27	550 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF11	Q92914	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CHP1	Q99653	195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPK	Q9BS16	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf50	Q9HD87	102 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PLLP	Q9Y342	182 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	STARD10	Q9Y365	291 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SPTA1	P02549	2419 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CIT	O14578	2027 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GVY2	172 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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