RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	SERPINA3	P01011	423 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ARL9	Q6T311	187 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OGG1	O15527	345 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	HRG	P04196	525 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SPARC	P09486	303 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EDNRA	P25101	427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TGFBR1	P36897	503 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	HSPB2	Q16082	182 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ETFDH	Q16134	617 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	LDAH	Q9H6V9	325 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EXO5	Q9H790	373 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GALNT8	Q9NY28	637 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RAMP1	O60894	148 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SYNGR4	O95473	234 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GPANK1	O95872	356 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ACTL6A	O96019	429 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CD1A	P06126	327 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	LAP3	P28838	519 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PTGS2	P35354	604 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TGM4	P49221	684 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CLDN15	P56746	228 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	FMOD	Q06828	376 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MOG	Q16653	247 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	NSMAF	Q92636	917 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	MMP27	Q9H306	513 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610		E9PI62	339 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610		H0YC42	278 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	GABRP	O00591	440 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EFS	O43281	561 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CEACAM4	O75871	244 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	AQP8	O94778	261 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	IL1A	P01583	271 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CSNK1A1	P48729	337 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	RORC	P51449	518 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	FABP5	Q01469	135 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-222	ENST00000534610	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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