RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP9P14780 707 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHCYP23526 432 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRATP43155 626 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP16P51512 607 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARF6P62330 175 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXC5Q00444 222 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSF2Q03933 536 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX10Q12887 443 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNA13Q14344 377 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC36A2Q495M3 483 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP157Q5JU67 520 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VRK2Q86Y07 508 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CREG2Q8IUH2 290 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COQ8BQ96D53 544 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2V2Q96R30 315 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAFAH2Q99487 392 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCM1Q9NP62 436 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A096LPI6 279 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX11AO75192 247 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN1SWP03999 348 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYL1P12980 280 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STOMP27105 288 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPHA3P29320 983 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHBP35232 272 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB9P50453 376 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BIDP55957 195 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1CBP62140 327 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY6EQ16553 131 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDHR4A6H8M9 788 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AZIN1O14977 448 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUSBP08236 651 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBP1P09467 338 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEFHP12036 1026 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARRB2P32121 409 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DS4P43632 304 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSG7Q13046 419 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF404Q494X3 552 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZR03 302 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINA11Q86U17 422 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD46Q86W74 232 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTOV1Q86YD1 416 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NATD1Q8N6N6 113 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAIQ8N9R8 606 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPERTQ8NA61 448 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLTPQ9NZD2 209 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WUJ7 227 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf98E9PRG8 122 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGN4O00479 90 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHYHO14832 338 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T1O43869 369 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPHS1O60500 1241 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAHP00439 452 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PF4V1P10720 104 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYL2P10916 166 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMO1P25800 156 aa8.37□□□□□ -1.07
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