RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530036.1

RPUSD4-204, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, human

TSL 3

Gene RPUSD4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD4-204	ENST00000530036	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	EME1	Q96AY2	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	RBP7	Q96R05	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	DDO	Q99489	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PKP2	Q99959	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	VCX	Q9H320	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036		H3BN98	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	UBL3	O95164	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	HLA-H	P01893	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ALPL	P05186	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	GAA	P10253	952 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CBR1	P16152	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NPR2	P20594	1047 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	MSR1	P21757	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PTAFR	P25105	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CD40	P25942	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NOS3	P29474	1203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CRABP1	P29762	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	VHL	P40337	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	GIPR	P48546	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF83	P51522	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ESRRG	P62508	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TUBA1B	P68363	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TUBA4A	P68366	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	CDK5	Q00535	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ETFDH	Q16134	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	MDP1	Q86V88	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	NSMAF	Q92636	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	HTRA1	Q92743	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPUSD4-204	ENST00000530036	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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