RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509018.5

RAPGEF6-208, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 8,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-208ENST00000509018 MMP11P24347 488 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRSS3P35030 304 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 HAAOP46952 286 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CAPZBP47756 277 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 APOOLQ6UXV4 268 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 WDR31Q8NA23 367 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 GHSRQ92847 366 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF488Q96MN9 340 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRIB3Q96RU7 358 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PLK3Q9H4B4 646 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CACNG2Q9Y698 323 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 A0A1W2PRX2 142 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 F5H5P2 479 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 K7EQS6 105 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC22A1O15245 554 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 GPR37O15354 613 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR5G3P0C626 314 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 NPBWR1P48145 328 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 REG1BP48304 166 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRR27Q6MZM9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 Q6ZTK2 550 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR5B12Q96R08 314 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.7□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 BTBD17A6NE02 478 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCL21O00585 134 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC31A2O15432 143 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR13C7P0DN81 318 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 T-ENOLP0DO92 83 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PAX6P26367 422 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SCGB2A2Q13296 93 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 AGAP6Q5VW22 663 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 FCGR1BQ92637 280 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LRIT2A6NDA9 550 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SPINK4O60575 86 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 IGHEP01854 428 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 P2RX1P51575 399 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 GPR176Q14439 515 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 RTP5Q14D33 572 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LYRM1O43325 122 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CD80P33681 288 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LY6DQ14210 128 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR51F2Q8NH61 342 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ADAM23O75077 832 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 CD63P08962 238 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC35E2P0CK97 266 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 KIAA1024LP59773 190 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLCO2A1Q92959 643 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 COPS3Q9UNS2 423 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF320A2RRD8 509 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SNAPC5O75971 98 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTGS2P35354 604 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SERPINF1P36955 418 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF91Q05481 1191 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 DUSP7Q16829 419 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 PXKQ7Z7A4 578 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 LINC01560Q8TB33 94 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 GNG13Q9P2W3 67 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 C9orf172C9J069 976 aa6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RAPGEF6-208ENST00000509018 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms