RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXB1	Q99853	325 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FUZ	Q9BT04	418 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GLTP	Q9NZD2	209 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	XKRY	O14609	159 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CRLF1	O75462	422 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	UBL3	O95164	117 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGR1A	P12314	374 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ACADS	P16219	412 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT4	P22083	530 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FPR3	P25089	353 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN31	Q12999	210 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST3H3	Q16695	136 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MICA	Q29983	383 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GSG1	Q2KHT4	349 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF75A	Q96N20	296 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RBP7	Q96R05	134 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM160	Q9NX00	188 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424		U3KQV3	271 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42EP2	O14613	210 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CD14	P08571	375 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A8	P0C604	315 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NPR2	P20594	1047 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTM3	P21266	225 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PCSK6	P29122	969 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CALCR	P30988	508 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMS1	P48059	325 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF84	P51523	738 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KA3	P51812	740 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	HGFAC	Q04756	655 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MELK	Q14680	651 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MDP1	Q86V88	176 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GIPC3	Q8TF64	312 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB10	Q8WXI3	467 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO17	Q96EF6	278 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf198	Q9H425	327 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	AP4S1	Q9Y587	144 aa		14.96	□□□□□ -0.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AHCYL1	O43865	530 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PTP4A3	O75365	173 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHM	P01871	453 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF35	P13682	527 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NR4A1	P22736	598 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A6	P31641	620 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PDLIM4	P50479	330 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ERF	P50548	548 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FANK1	Q8TC84	345 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DOK1	Q99704	481 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	VWC2L	B2RUY7	222 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	INAFM1	C9JVW0	142 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DHH	O43323	396 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PTH	P01270	115 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA5	P05154	406 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	QDPR	P09417	244 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PGA4	P0DJD7	388 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PGA3	P0DJD8	388 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAS	P25445	335 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NOS3	P29474	1203 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GLRX	P35754	106 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GSS	P48637	474 aa		14.94	□□□□□ -0.02

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