RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GPR87Q9BY21 358 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C21orf140B9A014 251 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ACOT7O00154 380 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF264O43296 627 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ICMTO60725 284 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TSC22D2O75157 780 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CD3GP09693 182 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TFPIP10646 304 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 UBL4AP11441 157 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CPN1P15169 458 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ATF1P18846 271 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MST1P26927 711 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IL12BP29460 328 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ACVR1BP36896 505 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GDNFP39905 211 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FOLR3P41439 243 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DGCR2P98153 550 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FHL1Q13642 323 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FAM209AQ5JX71 171 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 LINGO2Q7L985 606 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MARCH3Q86UD3 253 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SPICQ8N5J4 248 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR51A7Q8NH64 312 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf10Q9HB07 376 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 NANSQ9NR45 359 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GLTPQ9NZD2 209 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GNG8Q9UK08 70 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MOKQ9UQ07 419 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IFITM5A6NNB3 132 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SMLR1H3BR10 107 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DVL2O14641 736 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IMPA2O14732 288 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 IL5P05113 134 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PNMTP11086 282 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SDHBP21912 280 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 UQCRC1P31930 480 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PTGDSP41222 190 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SLC6A8P48029 635 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF81P51508 661 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A1P53007 311 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 RAP2BP61225 183 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DHODHQ02127 395 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF117Q03924 483 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 CHAF1BQ13112 559 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 BAMBIQ13145 260 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TP53I3Q53FA7 332 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 TOR2AQ5JU69 321 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DTX1Q86Y01 620 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 MISPQ8IVT2 679 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 OR8H3Q8N146 312 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF614Q8N883 585 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 GPR119Q8TDV5 335 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 LIPHQ8WWY8 451 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 HSD17B8Q92506 261 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-208ENST00000486964 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms