RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NAXEQ8NCW5 288 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TFAP2CQ92754 450 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MBOAT4Q96T53 435 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NUAK2Q9H093 628 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf198Q9H425 327 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RNF121Q9H920 327 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 B9D1Q9UPM9 204 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ESPL1Q14674 2120 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZG16O60844 167 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 UPK3AO75631 287 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GLCEO94923 617 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CGAP01215 116 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SPI1P17947 270 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GSTT1P30711 240 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CDH11P55287 796 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ADAM8P78325 824 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 HSF2Q03933 536 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 OCLNQ16625 522 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF691Q5VV52 312 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ARL9Q6T311 187 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 NRG4Q8WWG1 115 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MUS81Q96NY9 551 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MED18Q9BUE0 208 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 RASSF1Q9NS23 344 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 JKAMPQ9P055 326 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS50Q9UI38 385 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 KALRNO60229 2985 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-210ENST00000486889 MED12Q93074 2177 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR6C68A6NDL8 312 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM183AA6NL82 134 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 VSTM5A8MXK1 200 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 H7C1C5 153 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PRKYO43930 277 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RAD51DO75771 328 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SLC2A10O95528 541 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 APOC1P02654 83 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CST2P09228 141 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CD79AP11912 226 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 COX5AP20674 150 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HTR1FP30939 366 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2B10P36537 528 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SLC15A1P46059 708 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 MTNR1AP48039 350 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT6P53370 316 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 LCN6P62502 163 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ACTC1P68032 377 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ACTA1P68133 377 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 AQP6Q13520 282 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 APOFQ13790 326 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TAF13Q15543 124 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GSG1Q2KHT4 349 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM27BQ5VT28 67 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF544Q6NX49 715 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF627Q7L945 461 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR6V1Q8N148 313 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GJC3Q8NFK1 279 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.58□□□□□ -1.04
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