RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NUDT13Q86X67 352 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF573Q86YE8 665 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SYS1Q8N2H4 156 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CORO2AQ92828 525 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MIB2Q96AX9 1013 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TSSK3Q96PN8 268 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FRG2BQ96QU4 278 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NMES1Q9C002 83 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PRO3102Q9H379 93 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RGCCQ9H4X1 137 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DOK5Q9P104 306 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 STARD10Q9Y365 291 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MYO9BQ13459 2157 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 A0A0B4J2A0 478 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C2orf78A6NCI8 922 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 A6NIZ1 184 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR6C76A6NM76 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 B4DEV8 164 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C9J4A7 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 H0YIV9 168 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 K7EP13 123 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 M0R129 80 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PIRO00625 290 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FFAR1O14842 300 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CTNSO60931 367 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ADAP1O75689 374 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DFFBO76075 338 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF12O95522 483 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TRBC1P01850 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 APODP05090 189 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CTSLP07711 333 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 QDPRP09417 244 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NT5EP21589 574 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 BCKDHBP21953 392 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NFYBP25208 207 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ADORA2BP29275 332 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MC4RP32245 332 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V1E1P36543 226 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PTH2RP49190 550 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GATMP50440 423 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CCR5P51681 352 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TDGF1P3P51864 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ERVFC1-1P60608 527 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DEFB103AP81534 67 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TLE1Q04724 770 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CACNG1Q06432 222 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FZD5Q13467 585 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PDE7AQ13946 482 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CBFBQ13951 182 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GAMTQ14353 236 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CSRP2Q16527 193 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ISXQ2M1V0 245 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.377e-6■□□□□ 11
PKP4-211ENST00000481115 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.5□□□□□ -1.37
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