RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NRGN	Q92686	78 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	HTRA1	Q92743	480 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NINJ1	Q92982	152 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SH3GL3	Q99963	347 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	LIME1	Q9H400	295 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SIAE	Q9HAT2	523 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		8.25	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CENPE	Q02224	2701 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	APC	P25054	2843 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PPL8	197 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	DCTN6	O00399	190 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC16A7	O60669	478 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ATE1	O95260	518 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	RAB36	O95755	333 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	REN	P00797	406 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	RAF1	P04049	648 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CELA3B	P08861	270 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CST2	P09228	141 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CD79A	P11912	226 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	OSM	P13725	252 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	MSR1	P21757	451 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CRABP1	P29762	137 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GIPR	P48546	466 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	RAB1A	P62820	205 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NPRL3	Q12980	569 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ETFDH	Q16134	617 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZSCAN26	Q16670	478 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	PGGHG	Q32M88	737 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC36A2	Q495M3	483 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	FAM27B	Q5VT28	67 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	LEG1	Q6P5S2	330 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	PARP8	Q8N3A8	854 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SVOPL	Q8N434	492 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF611	Q8N823	705 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	OR4K13	Q8NH42	304 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NEUROG1	Q92886	237 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	FBXW5	Q969U6	566 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NMNAT3	Q96T66	252 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	NUAK2	Q9H093	628 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	POLE4	Q9NR33	117 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	EDAR	Q9UNE0	448 aa		8.24	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	OR6C68	A6NDL8	312 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887		G3V2T6	193 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887		H3BN98	237 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CRYAA	P02489	173 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SCG5	P05408	212 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	DANCR	P0C864	163 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	PATE4	P0C8F1	98 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GAA	P10253	952 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF23	P17027	643 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CD53	P19397	219 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	LAP3	P28838	519 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	CALCR	P30988	508 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GRK5	P34947	590 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	DAP	P51397	102 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	PIGF	Q07326	219 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	KCNMB1	Q16558	191 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SGCA	Q16586	387 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SLC22A25	Q6T423	547 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	SYT9	Q86SS6	491 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		8.23	□□□□□ -1.09
SFI1-222	ENST00000478887	OR6V1	Q8N148	313 aa		8.23	□□□□□ -1.09

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