RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	TAS2R31	P59538	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MEF2D	Q14814	521 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045		M0R135	149 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	VEGFC	P49767	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GP1BA	P07359	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CRHBP	P24387	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CATR1	Q13166	79 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	AMER3	Q8N944	861 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PRSS37	A4D1T9	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ARRB2	P32121	409 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC32	Q9BV29	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045		H7C2Y5	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ACOT8	O14734	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SPINT2	O43291	252 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	DIO1	P49895	249 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	FABP6	P51161	128 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MC2R	Q01718	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF117	Q03924	483 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RAB31	Q13636	194 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PHB2	Q99623	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PRRT1	Q99946	306 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MYO10	Q9HD67	2058 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045		H7C1Q1	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SLC16A6	O15403	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	CPT2	P23786	658 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GABRA5	P31644	462 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ETV5	P41161	510 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	HES1	Q14469	280 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RGS11	O94810	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	GABRA1	P14867	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SPI1	P17947	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	SRD5A2	P31213	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	TAS2R46	P59540	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.13	□□□□□ -0.63
IRF1-208	ENST00000472045	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms