RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	REG4	Q9BYZ8	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SOCS2	O14508	198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	GPRIN2	O60269	458 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB2	O95178	105 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PTH	P01270	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IGHM	P01871	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA5	P05154	406 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	HEXA	P06865	529 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN19	P0C672	248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	NR4A1	P22736	598 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	APLNR	P35414	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CENPA	P49450	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	EFNA4	P52798	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	HIST3H3	Q16695	136 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf128	Q5T292	105 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FAM168A	Q92567	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		Q96M85	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK17	Q96T54	332 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SYT3	Q9BQG1	590 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP13	Q9UII6	198 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPW3	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LCK	P06239	509 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	CD14	P08571	375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF32	P17041	273 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1B2	P21281	511 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LAP3	P28838	519 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PCSK6	P29122	969 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SPATS1	Q496A3	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DHFR2	Q86XF0	187 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC8	Q8TC99	324 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RASD2	Q96D21	266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TPK1	Q9H3S4	243 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SIAE	Q9HAT2	523 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R3D	O95685	299 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF35	P13682	527 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	IFNGR2	P38484	337 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	OMP	P47874	163 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	DSCR9	P59020	149 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	PPP2R2B	Q00005	443 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	THTPA	Q9BU02	230 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf198	Q9H425	327 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF11B	O00300	401 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SEMG1	P04279	462 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ADRA2A	P08913	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NOS3	P29474	1203 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SDHA	P31040	664 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LIMS1	P48059	325 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PPOX	P50336	477 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PDLIM4	P50479	330 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	RPS6KA3	P51812	740 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOV	P59797	346 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FHL1	Q13642	323 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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