RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	RORB	Q92753	470 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	WAC	Q9BTA9	647 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	PHYH	O14832	338 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	DHH	O43323	396 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	GAA	P10253	952 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SELENOP	P49908	381 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ETV1	P50549	477 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	BDH1	Q02338	343 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR50	Q13585	617 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SPHAR	Q15513	63 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ETFDH	Q16134	617 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	C3AR1	Q16581	482 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR76	Q9H967	626 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SPTA1	P02549	2419 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	FREM3	P0C091	2139 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	TMCC2	O75069	709 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1C4	O75897	302 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	NPR2	P20594	1047 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP2K4	P45985	399 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	OR3A2	P47893	321 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ENTPD1	P49961	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ROM1	Q03395	351 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF85	Q03923	595 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	EGR3	Q06889	387 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	TPBG	Q13641	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB2	Q16082	182 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	UPK3A	O75631	287 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	PTH	P01270	115 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	SCG5	P05408	212 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	CD1A	P06126	327 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF823	P16415	610 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	AGTR1	P30556	359 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF84	P51523	738 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT4	P56705	351 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTA2	P62736	377 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTG2	P63267	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H3A	P68431	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	FMOD	Q06828	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61

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