RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	CA10	Q9NS85	328 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308		B9A039	149 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308		H0YAE9	185 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	ESRRG	P62508	458 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	EFNB3	Q15768	340 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	CARTPT	Q16568	116 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC16A6	O15403	523 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	IFI30	P13284	250 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	OSM	P13725	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	GIF	P27352	417 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC9A3	P48764	834 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PPOX	P50336	477 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	RUNX1T1	Q06455	604 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	HPS1	Q92902	700 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	GPA33	Q99795	319 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2T1	O43869	369 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	OR7A10	O76100	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SNAP29	O95721	258 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	CRYAA	P02489	173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TACSTD2	P09758	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	IMPDH2	P12268	514 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	CCNA2	P20248	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MAK	P20794	623 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF74	Q16587	644 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	IL20	Q9NYY1	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	CDC42EP2	O14613	210 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PTP4A3	O75365	173 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4A8	P0C604	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	CHN2	P52757	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	NPRL3	Q12980	569 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf159	Q96HA4	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308		Q9H521	79 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	DYSF	O75923	2080 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSSC4-208	ENST00000467308	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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