RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	CCL21	O00585	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SOCS2	O14508	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC16A6	O15403	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LRRTM2	O43300	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	E2F6	O75461	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF23	P17027	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF43	P17038	809 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EPHA2	P29317	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SDHA	P31040	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TFF3	Q07654	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DAG1	Q14118	895 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ACKR1	Q16570	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KDM8	Q8N371	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CIB1	Q99828	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731		A6NIZ1	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731		J3QKU1	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EI24	O14681	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR6A2	O95222	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	BCL10	O95999	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	POU2F1	P14859	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ACADS	P16219	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGFBP2	P18065	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	COX5A	P20674	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PTN	P21246	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EDNRA	P25101	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LMO1	P25800	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CHRNB4	P30926	498 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC6A6	P31641	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CRISP1	P54107	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CTXN1	P60606	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RAP1B	P61224	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RAP1A	P62834	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NPRL3	Q12980	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	P2RY6	Q15077	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms