RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445070.1

AC096541.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC096541.1, Length 1,807 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC096541.1-201ENST00000445070 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 S100ZQ8WXG8 99 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 KCNN2Q9H2S1 579 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 TPK1Q9H3S4 243 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.15■□□□□ 0.82
AC096541.1-201ENST00000445070 CELA3AP09093 270 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SPARCP09486 303 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MEOX1P50221 254 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CLDN17P56750 224 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SLC17A1Q14916 467 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HYAL4Q2M3T9 481 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 TEX30Q5JUR7 227 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 BORCS5Q969J3 196 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SCMH1Q96GD3 660 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 OR8B4Q96RC9 309 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF726A6NNF4 738 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HSPB2A8KAH6 182 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HRGP04196 525 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CD46P15529 392 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CARD18P57730 90 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 NHLH1Q02575 133 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CDC20Q12834 499 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF846Q147U1 533 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HSPB2Q16082 182 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 NSMAFQ92636 917 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HMG20AQ9NP66 347 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 FAM166BA8MTA8 275 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MAGEA5P43359 124 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CCL11P51671 97 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CARD17Q5XLA6 110 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 OR10D3Q8NH80 312 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 FNDC8Q8TC99 324 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HSD17B8Q92506 261 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ABHD6Q9BV23 337 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.13■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 J3QRK9 145 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CXCL13O43927 109 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 GPRIN2O60269 458 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF823P16415 610 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ARG2P78540 354 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 PLGLB1Q02325 96 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ROM1Q03395 351 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MCHR2Q969V1 340 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MAP6Q96JE9 813 aa20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CASKO14936 926 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 LAP3P28838 519 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 CTDSP2O14595 271 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 AQP8O94778 261 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 SERPINA3P01011 423 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 MTNR1BP49286 362 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 INAQ16352 499 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 ZNF766Q5HY98 468 aa20.11■□□□□ 0.81
AC096541.1-201ENST00000445070 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms