RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 CACNA1CQ13936 2221 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 KNL1Q8NG31 2342 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 A0A087X0M5 115 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 A0A1B0GX30 115 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CD300LBA8K4G0 201 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TGOLN2O43493 480 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SLC34A2O95436 690 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 IGHG1P01857 330 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PTPN6P29350 595 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MC2RQ01718 297 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 BDH1Q02338 343 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LTBQ06643 244 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HYAL2Q12891 473 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OPN5Q6U736 354 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GATSQ8NAP1 163 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR1S1Q8NH92 325 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 DIO2Q92813 273 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TNFRSF14Q92956 283 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 NAT6Q93015 286 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 EID2BQ96D98 161 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MISP3Q96FF7 219 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LYSMD1Q96S90 227 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FZD3Q9NPG1 666 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CUTCQ9NTM9 273 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MYOTQ9UBF9 498 aa5.86□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LRIT2A6NDA9 550 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FAM74A7A6NL05 159 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C22orf46C9J442 243 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PLPP1O14494 284 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CBR3O75828 277 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PMS2P2O95744 297 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 LALBAP00709 142 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SOX18P35713 384 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TNFRSF4P43489 277 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CAV2P51636 162 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 RAB38P57729 211 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR8G1Q15617 311 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 Q499Y3 187 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 REC114Q7Z4M0 266 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MKXQ8IYA7 352 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-211ENST00000439476 PEX11GQ96HA9 241 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ASB16Q96NS5 453 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MS4A8Q9BY19 250 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TREM2Q9NZC2 230 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CBLCQ9ULV8 474 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TVP23AA6NH52 213 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 A6NLC8 198 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 HMGN4O00479 90 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CHRM2P08172 466 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SPP1P10451 314 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 CSNK1A1P48729 337 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 GZMMP51124 257 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-211ENST00000439476 OR1Q1Q15612 314 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-211ENST00000439476 FCRLAQ7L513 359 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FRMD1Q8N878 549 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-211ENST00000439476 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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BDNF-211ENST00000439476 OPA3Q9H6K4 179 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 ARID2Q68CP9 1835 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 C17orf105B2RV13 164 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 TK1P04183 234 aa5.85□□□□□ -1.47
BDNF-211ENST00000439476 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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